MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo chromosome

Total Repeats: 2001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017238	AT	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017238	AT	3	6	714	719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017238	AC	3	6	720	725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017238	CAA	2	6	741	746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017238	A	7	7	3292	3298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017238	TAA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017238	ATT	2	6	3333	3338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017238	TAT	2	6	3344	3349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017238	AAT	2	6	3353	3358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017238	A	6	6	3379	3384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017238	ATA	2	6	5203	5208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017238	CAC	2	6	5216	5221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017238	CTC	2	6	7397	7402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017238	T	7	7	7409	7415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017238	GCT	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017238	A	7	7	7432	7438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017238	TAA	2	6	7445	7450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017238	AATTT	2	10	8322	8331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017238	TTAT	2	8	8347	8354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017238	AT	3	6	8353	8358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017238	TAT	2	6	8363	8368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017238	TTA	2	6	12760	12765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017238	AATA	2	8	12778	12785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017238	TAAA	2	8	12792	12799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017238	T	9	9	12801	12809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017238	A	6	6	15663	15668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017238	A	9	9	15677	15685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017238	AAC	2	6	15690	15695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017238	A	8	8	15750	15757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017238	A	7	7	15759	15765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017238	T	8	8	15779	15786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017238	AAGT	2	8	15807	15814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017238	TCC	2	6	20002	20007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017238	TAAT	2	8	20015	20022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017238	AAT	2	6	20056	20061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017238	ATTTTA	2	12	22152	22163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017238	AATTA	2	10	22786	22795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017238	TTA	2	6	25670	25675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017238	TAT	2	6	25676	25681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017238	TAA	2	6	25713	25718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017238	ATTT	2	8	25737	25744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017238	TAA	2	6	25752	25757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017238	TAA	2	6	25765	25770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017238	CTT	2	6	29397	29402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017238	CTT	2	6	29424	29429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017238	TC	3	6	29451	29456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017238	A	6	6	29470	29475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017238	TCT	2	6	29493	29498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017238	TAACC	2	10	29507	29516	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017238	TAA	3	9	31562	31570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017238	TTA	2	6	32125	32130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017238	TAT	2	6	32138	32143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017238	A	6	6	32165	32170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017238	TATT	2	8	38154	38161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017238	AAC	2	6	39669	39674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017238	TAA	2	6	39678	39683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017238	TAA	2	6	39694	39699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017238	ACT	2	6	39704	39709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017238	A	6	6	39724	39729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017238	TAT	2	6	39771	39776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017238	A	7	7	39783	39789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017238	TC	3	6	39818	39823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017238	ATT	2	6	40722	40727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017238	TTC	2	6	40730	40735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017238	ATTT	2	8	40743	40750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017238	AAT	2	6	40768	40773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017238	AATTAA	2	12	45379	45390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017238	TAA	2	6	45402	45407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017238	TAA	2	6	45426	45431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017238	ATAA	2	8	46010	46017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017238	TCC	2	6	46401	46406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017238	AATT	2	8	46441	46448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017238	A	10	10	46459	46468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017238	TAA	2	6	46491	46496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017238	T	8	8	46518	46525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017238	AAGTA	2	10	46530	46539	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017238	ATG	2	6	46589	46594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017238	ATA	2	6	46623	46628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017238	TCT	2	6	46635	46640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017238	A	6	6	46684	46689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017238	AAAT	2	8	46692	46699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017238	AAGC	2	8	46859	46866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017238	CAA	2	6	46909	46914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017238	CT	3	6	46917	46922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017238	ACA	2	6	47092	47097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017238	TAC	2	6	47099	47104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017238	ACTAA	2	10	47118	47127	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017238	TAA	2	6	47135	47140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017238	ATAA	2	8	47856	47863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017238	A	6	6	47862	47867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017238	TAAT	2	8	47880	47887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017238	AT	3	6	49301	49306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017238	TA	3	6	49328	49333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017238	TAA	2	6	50026	50031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017238	A	6	6	50063	50068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017238	TTA	2	6	52411	52416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017238	TCC	2	6	53449	53454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017238	T	7	7	53457	53463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017238	ATT	2	6	53482	53487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017238	TAA	3	9	53499	53507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017238	AT	3	6	56746	56751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017238	ACAT	2	8	56761	56768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017238	TAAAT	2	10	56778	56787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017238	TATTT	2	10	56788	56797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017238	C	6	6	57170	57175	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_017238	TAA	3	9	57209	57217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017238	TAT	2	6	57967	57972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017238	AATC	2	8	57977	57984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017238	ATTT	2	8	59023	59030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017238	ATT	3	9	59042	59050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017238	CAAA	2	8	60515	60522	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017238	A	6	6	60520	60525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017238	AAT	2	6	63032	63037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017238	A	12	12	63047	63058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017238	AGG	2	6	65237	65242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017238	A	7	7	65719	65725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017238	GAAA	2	8	70102	70109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017238	AAAT	2	8	70110	70117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017238	GGA	2	6	70146	70151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017238	A	6	6	70161	70166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017238	GAAA	2	8	70196	70203	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017238	AAG	2	6	70243	70248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017238	TTA	2	6	70249	70254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017238	A	6	6	70271	70276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017238	CAA	2	6	70304	70309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017238	TG	3	6	70330	70335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017238	ATT	2	6	70338	70343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017238	TAG	2	6	70361	70366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017238	A	6	6	79302	79307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017238	A	6	6	79333	79338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017238	TAAATT	2	12	79339	79350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017238	T	7	7	79349	79355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017238	A	7	7	79356	79362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017238	ATT	2	6	79365	79370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017238	TAA	2	6	79374	79379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017238	A	6	6	79405	79410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017238	ATT	2	6	79421	79426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017238	TCTT	2	8	80780	80787	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017238	T	6	6	80786	80791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017238	TTTCA	2	10	80799	80808	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017238	ATT	2	6	80821	80826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017238	TTTA	2	8	80875	80882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017238	TAT	2	6	80903	80908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017238	TAA	2	6	80914	80919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017238	AAAAT	2	10	80927	80936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017238	TACA	2	8	83908	83915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017238	A	6	6	83986	83991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017238	TCCT	2	8	85810	85817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017238	AT	3	6	86823	86828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017238	ATTAAA	2	12	86862	86873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017238	ATA	2	6	86878	86883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_017238	ATCAA	2	10	220000	220009	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
440	NC_017238	CTA	2	6	220248	220253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_017238	T	6	6	220314	220319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017238	AT	3	6	220358	220363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_017238	T	6	6	220451	220456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017238	AGA	2	6	220501	220506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
445	NC_017238	TAA	2	6	220524	220529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_017238	TCA	2	6	220532	220537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_017238	AAT	2	6	220567	220572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_017238	T	6	6	221031	221036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_017238	TA	3	6	221065	221070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_017238	CCT	2	6	224119	224124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
451	NC_017238	CAA	2	6	224137	224142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_017238	ATA	2	6	224143	224148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017238	ATA	2	6	227880	227885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017238	AAT	2	6	227898	227903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017238	ACATT	2	10	227919	227928	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
456	NC_017238	ACAT	2	8	227940	227947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
457	NC_017238	T	7	7	228150	228156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_017238	T	6	6	228204	228209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_017238	AGT	2	6	228246	228251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_017238	A	8	8	228252	228259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_017238	ATA	2	6	228281	228286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017238	AAT	2	6	228309	228314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017238	TAAA	2	8	230647	230654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017238	ATA	2	6	230685	230690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017238	TTA	2	6	230707	230712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_017238	TA	3	6	230711	230716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_017238	AATA	2	8	230737	230744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017238	ATC	2	6	230757	230762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
469	NC_017238	A	6	6	234422	234427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_017238	CTC	2	6	234689	234694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
471	NC_017238	AAT	2	6	234727	234732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017238	TTA	3	9	236341	236349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017238	TAA	2	6	236352	236357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017238	A	6	6	236356	236361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_017238	ATT	2	6	237390	237395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_017238	AAT	2	6	237400	237405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_017238	AT	3	6	237410	237415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_017238	TCAA	2	8	237434	237441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
479	NC_017238	TAA	2	6	239404	239409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_017238	ATA	2	6	241481	241486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_017238	A	7	7	241488	241494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017238	ATT	2	6	241513	241518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017238	AT	3	6	241533	241538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_017238	CAT	2	6	241541	241546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
485	NC_017238	TAC	2	6	241552	241557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
486	NC_017238	TAA	2	6	241558	241563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017238	TAA	2	6	241567	241572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_017238	A	6	6	241577	241582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_017238	AAG	2	6	243224	243229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_017238	TCA	2	6	243274	243279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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493	NC_017238	AAAT	2	8	243402	243409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_017238	TAA	2	6	243458	243463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_017238	AT	3	6	243499	243504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_017238	T	6	6	243542	243547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_017238	AAC	2	6	243594	243599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_017238	TA	3	6	243735	243740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017238	ATA	2	6	243756	243761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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